La revista Manga Time Kirara Magica a anunciado en el Nº 8 de este año, la publicación del manga de la tercera película de Madoka Magica: Gekijō-ban Mahō Shōjo Madoka Magica Shinpen: Hangyaku no Monogatari.
Al igual que la película en la que se basa: Mahou Shoujo Madoka★Magica (魔法少女まどか★マギカ), Gekijō-ban Mahō Shōjo Madoka Magica Shinpen se desarrolla una historia nueva que da continuidad a la historia original. El filme que cierra la trilogía cinematográfica del popular mahô shôjo se estrenará en Japón el 26 de abril.
El dibujante de dicho manga será Hanokage, como ya lo hiciera con la serie de animación, con el primer manga de Madoka Magica, y con Puella Magi Madoka Magica 〜The Different Story〜, una historia paralela que también fue publicada por la revista Manga Time Kirara Magica. Esta última finalizó con un total de 3 tomos recopilatorios.
Ademas la franquicia cuenta con varios spin-off y diversas publicaciones basadas en el anime, entre ellas Gen Urobuchi. Puella Magi Kazumi Magica: The Innocent Malice, escrita por Masaki Hiramatsu e ilustrada por Takashi Tensugi. Una historia a parte de la serie original que se centra en la joven Kazumi, que ha perdido la memoria después de haber sido secuestrada.
La obra finalizó con 5 tomos recopilatorios en el mercado japonés.